В 1968 году в г. Уфе была введена в строй первая в мире опытно-промышленная установка по производству белка из нефтяных парафинов. После успешного пуска этой установки началось строительство крупных биохимических предприятий — Кстовского завода БВК, Благовещенского биохимкомбината и др. предприятий.

Для обеспечения строящихся и действующих предприятий инженерными кадрами по решению Министерства высшего образования СССР в 1971 году в Уфимском нефтяном институте при кафедре химии нефти и нефтехимического синтеза (зав. кафедрой профессор А.З. Биккулов) в рамках специальности «Технология органического и нефтехимического синтеза» была организована специализация «Технология микробиологических производств».

В 1973 году выпускники этой кафедры получили дипломы инженеров и были направлены на многие предприятия Министерства медицинской и микробиологической промышленности. В этом же году в соответствии с приказом МинВУЗа РСФСР на первый курс было принято 50 абитуриентов по новой специальности.

Основная работа по созданию лабораторной базы новой специальности была развернута в 1975-76 годах. В этой работе деятельное участие приняли доценты Р.Н. Хлесткин и Ю.Ф. Соков.
20 августа 1976 года приказом № 52-Д в Уфимском нефтяном институте была образована самостоятельная кафедра биохимии и технологии микробиологических производств под руководством кандидата химических наук доцента Р.Н. Хлесткина.

Хлесткин Рудольф Николаевич
доктор технических наук, профессор, член-корреспондент Инженерной академии РБ, заслуженный деятель науки РБ
Почетный профессор Атераусского института нефти и газа, Почетный работник высшего профессионального образования РФ
Заведующий кафедрой с 1976 по 1986 гг.

В становлении кафедры принимали активное участие доцент Ю.Ф. Соков, доцент А.И. Мелентьев, ассистент В.М. Коробов, старшие преподаватели Л.Г. Фаткуллина, Р.Х. Хазипов.

Коллектив кафедры, 1978 г.
первый ряд (справа налево): Морозов А.М., Мелентьев А.И., Фаткуллина Л.Г., Хлесткин Р.Н., Сафарова В.Г., Коробов В.М.
второй ряд (справа налево): Сорокина И.А., Ерохина Т.М., Мухортова Т.М., Ивлиева Т.Я., Паташова Л.А., Красногорская Н.Н., Усанов Н.Г., Мохова Н.К., Гареев В.М.

В 1978 году состоялся первый выпуск инженеров-технологов микробиологических производств.

Группа НТБ-73-1

К середине 1980 годов кафедра «Биохимия и технология микробиологических производств» УГНТУ наряду с родственными кафедрами в г. Москве, Ленинграде, Казани, Минске, стала авторитетным центром научных исследований и подготовки кадров для микробиологической промышленности.

Коллектив кафедры, 1985 г.

первый ряд (справа налево): Ягафарова Г.Г., Хлесткин Р.Н., Сафарова В.Г., Соков Ю.Ф.

второй ряд (справа налево): Ивлиева Т.Я., Зиновьев А.П., Красногорская Н.Н., Усанов Н.Г., Габдикеева А.

третий ряд (справа налево): Гареев В.М.,Халимова Л.Х., Зданчук Т.Г., Логинов О.Н., Маннанова Р.

С 1987 года кафедрой заведует Заслуженный деятель науки Российской Федерации, Почетный работник высшего профессионального образования РФ, чл.-корр. Академии наук Республики Башкортостан, доктор химических наук, профессор Владимир Викторович Зорин.

Коллектив преподавателей кафедры существенно пополнился ее выпускниками, в том числе кандидатами наук (А.M. Морозов, Н.Г.Усанов, Ф.А. Прищепов, Н.И. Петухова), прошедшими стажировку в аспирантурах ведущих научных центров страны: МГУ им. М.В. Ломоносова, РХТУ им. Д.И. Менделеева, Московского государственного университета пищевой промышленности. В состав кафедры также вошли кандидат технических наук Л.Х. Халимова, кандидат химических наук С.С. Вершинин, кандидат химических наук Р.Н. Шахмаев, кандидат технических наук Л.Я. Василова, кандидат химических наук А.Р. Чанышева и другие, выполнившие диссертационные работы на кафедре.

Коллектив кафедры, 2008 г.

первый ряд (справа налево): Халимова Л.Х., Василова Л.Я., Сафарова В.Г., Чанышева А.Р., Сюндюкова Ю.Р., Шахмаев Р.Н.;

второй ряд (справа налево): Комлева Е.В., Прищепов Ф.А., Петухова Н.И., Зорин В.В., Зиннурова А.Д., Вершинин С.С., Султанова Л.М., Коньшина И.И., Аскин А.


Коллектив кафедры, 2021 г.

В это время (2021 год) на кафедре работают: проф., доктор химических наук В. В. Зорин; доц., кандидат химических наук В. Г. Сафарова; доцент, кандидат биологических наук Н. И. Петухова; доцент, кандидат технических наук Л. Х. Халимова; доц., кандидат технических наук Ф. А. Прищепов; доцент, кандидат химических наук С. С. Вершинин, доцент, кандидат химических наук Р. Н. Шахмаев, доцент, кандидат технических наук Л. Я.Василова, кандидат химических наук А.Р. Чанышева, кандидат химических наук А.Т. Зайнашев, старший преподаватель А.А. Шакирова, заведующий лабораториями А. Н. Скорняков и др.

В области фундаментальных и прикладных научных исследований, а также подготовки бакалавров, магистров и кадров высшей квалификации кафедра в течении многих лет сотрудничает с научными учреждениями, ВУЗами и предприятиями как Российской Федерации, так и странами дальнего зарубежья.

В их числе научно-исследовательские институты УФИЦ РАН (г. Уфа); научно-исследовательский центр имени Николы Тесла (Республика Марий Эл, г. Йошкар-Ола); Санкт-Петербургский государственный технический университет (г. Санкт-Петербург); Казанский национальный исследовательский технологический университет (г. Казань); Региональный центр инжиниринга Республики Башкортостан на базе ГБУ НИТИГ АН РБ; Департамент биогеохимии изотопов Центра по исследованию окружающей среды им. Гельмгольца (Германия, г. Лейпциг); Северо-Казахстанский государственный университет имени Манаша Козыбаева (Казахстан); Французский институт нефти (Франция, г. Париж); Университет города Бургаса (Болгария); «Иммунопрепарат» – филиал ФГУП НПО "Микроген"; ОАО "Фармстандарт-УфаВИТА"; ООО ИЦ «Бирюч – новые технологии» ГК «ЭФКО»; ООО «НВП «БашИнком».

С 2005 года в УГНТУ функционирует совместная с Институтом органической химии УНЦ РАН (ныне – Уфимский институт химии РАН) базовая учебно-научно-исследовательская лаборатория «Био- и органической химии» (Научный руководитель: М.С. Юнусов – академик РАН, координатор от УГНТУ – кафедра БТМП).

Совместно с Уфимским институтом химии УФИЦ РАН создана базовая кафедра «Синтез биологически активных веществ».
Имеется договор о создании ассоциации родственных кафедр Уфимского государственного нефтяного технического университета и Башкирского государственного университета для осуществления обмена опытом в организации и проведении учебной и учебно-исследовательской работы, совместной подготовке и выполнении научных проектов, организации научных и методических конференций и т.д.
Кафедра активно сотрудничает с родственными кафедрами Казанского национального исследовательского технологического университета (КНИТУ) по вопросам аттестации кадров высшей квалификации. Ряд аспирантов кафедры проходили экспертизу диссертационных работ на кафедрах «Промышленной биотехнологии» и «Пищевой биотехнологии» КНИТУ.

В 1997 году при поддержке Федеральной целевой программы «Государственная поддержка интеграции высшего образования и фундаментальной науки» путем объединения интеллектуального потенциала и материально-технической базы кафедры «Биохимия и технология микробиологических производств» УГНТУ и ряда лабораторий Института органической химии УНЦ РАН был создан Учебно-научный Центр, деятельность которого направлена на улучшение качества подготовки молодых специалистов и кадров высшей квалификации, а также на повышение уровня научных исследований в области био- и органической химии, химической технологии, биотехнологии.

В 1999 году Центр был преобразован в новый комплексный Учебно-научный Центр Биоорганической химии и механики многофазных систем на базе УГНТУ, ИОХ УНЦ РАН, БашГУ и ИБ УНЦ РАН.

В 2009 году для интеграции и координации усилий учебного, научного и инновационно-внедренческого потенциала кафедры «Биохимия и технология микробиологических производств» и базовой учебно-научно-исследовательской лаборатории «Био- и органическая химия» создан Научно-образовательный центр «Химия и биотехнология».

В 2010 году с целью обеспечения создания и развития системы эффективного использования инновационного потенциала УГНТУ в соответствии с программой развития научной и образовательной деятельности Университета, а также внедрения научно-технических результатов в производство создан Инновационный центр «ИНОЦ Химия и биотехнология». При поддержке Минобрнауки РФ в рамках аналитической ведомственной целевой программы «Развитие научного потенциала высшей школы» (2005–2011 гг.) на основе коллекции микроорганизмов кафедры биохимии и технологии микробиологических производств создан музей культур микроорганизмов УГНТУ.
В области фундаментальных и прикладных научных исследований, а также подготовки бакалавров, инженеров, магистров и кадров высшей квалификации кафедра «Биохимия и технология микробиологических производств» сотрудничает с научными учреждениями и вузами как Российской Федерации, так и государств СНГ и дальнего зарубежья.

За период с 2008 по 2012 годы Уфимский государственный нефтяной технический университет заключил ряд договоров и соглашений о сотрудничестве, предполагающих участие сотрудников кафедры «Биохимия и технология микробиологических производств» в их реализации (договор о сотрудничестве и взаимовыгодном партнерстве с Научно-исследовательским центром имени Николы Тесла (Республика Марий Эл, г. Йошкар-Ола); договор о сотрудничестве и взаимовыгодном партнерстве с Санкт-Петербургским государственным техническим университетом (г. Санкт-Петербург); договор о сотрудничестве и взаимовыгодном партнерстве с Институтом органической химии УНЦ РАН (г. Уфа); соглашение о сотрудничестве с Департаментом биогеохимии изотопов Центра по исследованию окружающей среды им. Гельмгольца (Германия, г. Лейпциг); соглашение о научном сотрудничестве с Северо-Казахстанским государственным университетом имени Манаша Козыбаева (Казахстан).

В 2011 году группа сотрудников кафедры в составе профессора В. В. Зорина, доцентов С. С. Вершинина, Р. Н. Шахмаева, Н. И. Петуховой, Л. Х. Халимовой и старшего преподавателя Л. М. Султановой приняли участие в научном семинаре «Биогеохимические концепции использования изотопов для оценки структуры, функций и активности микробиологической деградации» в Центре исследований окружающей среды им. Гельмгольца (Германия, г. Лейпциг). Группа приобрела новые знания в области экологической биотехнологии и биогеохимии, ознакомилась с передовой научной техникой и получила опыт общения с зарубежными коллегами. В свою очередь, по приглашению кафедры, ведущий сотрудник департамента изотопной биогеохимии Центра исследований окружающей среды им. Гельмгольца, доктор Карстен Вогт участвовал на Международном семинаре в УГНТУ в ноябре 2011 года с лекцией «Исследование стабильных изотопов для оценки естественных затухающих процессов».

В ноябре 2012 года группа сотрудников кафедры БТМП в составе профессора В. В. Зорина, доцентов С. С. Вершинина, Н. И. Петуховой и инженера А. Т. Зайнашева прошла стажировку в рамках программы повышения квалификации во Французском институте нефти. Стажеры принимали участие в работе семинаров по актуальным темам: «Возобновляемые источники энергии», «Биотоплива I, II и III поколения», «Трансформация биомассы в химические продукты». Группа ознакомилась с проблемами мировой энергетики, с методами и технологиями хранения энергии, с видами возобновляемых источников энергии. Была систематизирована информация по биотопливам I, II и III поколений, изучены перспективные способы трансформации биомассы в химические продукты с использованием методов катализа и биокатализа. При посещении отдела биотехнологии Французского института нефти сотрудники ознакомились с задачами, решаемыми в лабораториях, и передовым научным оборудованием и приборами.

В ноябре 2012 года на Международном семинаре, по приглашению кафедры, выступала с докладом «Инновационные разработки в химии полимеров» ведущий научный сотрудник исследовательского департамента Hanita Coatings RCA Ltd., Kibbutz Hanita (Израиль), доктор Н. Фридман.

В рамках реализации развития программы академической мобильности профессор В. В. Зорин выступал с докладом о перспективных биокаталитических и биосинтетических методах, используемых при создании низкомолекулярных биорегуляторов, в Санкт-Петербургском государственном технологическом институте (университете).

В 2014 году многолетнее сотрудничество между кафедрой БТМП и Институтом биологии УНЦ РАН в области подготовки специалистов по специальности «Биотехнология» и кадров высшей квалификации, а также проведение совместных научных исследований и активное участие в становлении «Биотехнологического кластера РБ», способствовало заключению нового договора о сотрудничестве  между ФГБУН Институтом биологии УНЦ РАН и ФГБОУ ВО УГНТУ.

В 2018 года на базе Уфимского института химии УФИЦ РАН открыта базовая кафедра «Синтез биологически активных веществ» для проведения исследований в рамках НИР магистрантов под руководством профессора, доктора химических наук Ишмуратова Г.Ю., а также для проведения учебной, производственной и преддипломной практик бакалавров и магистров направления «Биотехнология».
В 2019 году на базе АО «НПО «Микроген», филиал в г. Уфа «Иммунопрепарат» создана базовая кафедра «Иммунобиотехнология».
В 2020 - 2023 учебном году начата подготовка студентов в корпоративных группах по заказу АО «ПОЛИЭФ», входящего в ПАО «СИБУРхолдинг» и АО «НПО «Микроген», филиал в г. Уфа «Иммунопрепарат» по разработанным магистерским программам: «Промышленная биотехнология и биоинженерия (в нефтехимии)» и «Промышленная биотехнология и биоинженерия (производство иммунобиологических препаратов)».