История создания университета тесно связана с открытием месторождений нефти в Башкирии. Нефтяным промыслам не хватало специалистов, способных решать важные производственные и сложные технические вопросы бурения скважин, освоения нефтяных и газовых месторождений и добычи нефти. Открытие нефтяного техникума в Стерлитамаке в 1932 году не решило проблему, и в 1934 году Московский нефтяной институт имени академика Губкина начал целевой прием студентов для нефтяной промышленности Башкортостана. В 1941 году он был эвакуирован в Уфу, а после его возвращения в Москву в нашем городе остался филиал. Министерство нефтяной промышленности, будучи заинтересовано в подготовке специалистов-нефтяников в Башкирии, привлекало к обучению студентов  крупных специалистов с нефтяных заводов и промыслов. Для выполнения плана набора студентов были организованы подготовительные курсы.  

И наконец, 4 октября 1948 года было принято Постановление Совета Министров СССР №3774, на основании которого приказом Министерства высшего образования СССР №1538 от 28 октября 1948 года Уфимский филиал получил окончательный статус самостоятельного Уфимского нефтяного института.